第三，是基于应用的互补性。根据企业目前的内外部条件，企业在引进电子商务时，不会完全摒弃传统的采购与销售模式，而是两种模式、两个系统共存，互为补充。
用联系的观点去看待整合
电子商务和ERP都是知识经济浪潮中孕育而生的产物，它们之间存在着不同，却又相互紧密地联系在一起。如果说企业信息化建设的第三个阶段是建设企业核心的业务管理和应用系统阶段，在这个阶段最有代表性的是企业内部的ERP——它不是机械地适应企业现有的流程，而是对企业流程中不合理的部分提出改进和优化建议，并可能导致组织机构的重新设计和业务流程重组。那么我们不难得出一个结论：电子商务是建立在ERP基础之上的应用。也就是说，ERP是企业实施电子商务的支撑系统。
从另一个角度来看，电子商务与ERP可以被归为同一个层次的应用，只是侧重点不同——ERP主要针对企业内部的管理，而电子商务是以与外部交互为主。企业如果在ERP系统不完善的情况下急于开展电子商务，往往会导致很多意想不到的情况发生，而这些事情往往会给企业的形象、信誉带来很大的损害。例如，现在国内很多交易网站就常出现这种情况，它们在网上接到大量的订单，却无法自动对订单进行处理，最后造成有的订单丢失，有的货物没给顾客送去，甚至有的货物在网上显示还有几件，但到库房里去查却发现没有了。如果企业前端的B2B系统与后台ERP系统脱节，这些让消费者不高兴的事情便会经常发生。企业要想真正在电子商务上有所作为，其后台的ERP系统就必须建好。因此，由于电子商务与ERP之间存在着种种密切的联系，我们不能再把它们简单地看作是两个独立的对象，而是应该用联系的观点去认识和研究它们。
企业要想在ERP系统上完美应用电子商务并不是一件容易的事情。国外电子商务的飞速发展，是在完成工业化，进入信息化，计算机的应用已经相当普及，信用卡的应用已达到相当高的水平，在信誉验证、结算与支付、配送与物流系统、安全保密措施以及法律法令等方面有了可靠保障的情况下实现的。开展B2B应用的企业如果没有一套ERP系统是不可能具备迅速及可靠响应的。ERP就像企业练的内功，没有这点内功，就很难在市场上冲杀。
一般说来，企业的信息化首先要完成的是企业范围内信息的沟通，建立与各分公司、分厂、办事处、销售网点、地区仓库联系的企业内部网(Intranet)以及办公自动化系统(OA)，建立企业的Web网页和电子邮件系统，与长期合作伙伴之间建立企业外联网(Extranet)或电子数据交换系统(EDI)。当ERP和电子商务在初始整合的时候，两个系统下的采购数据、销售数据和财务数据如果没有进行合并，必然会造成数据失去一致性和完整性；而软件资源、硬件资源和数据资源如果没有充分共享，会造成建设成本过高和存储空间浪费。这些都是我们在对电子商务平台和ERP系统整合时应该重点关注的地方。如果我们将新的整合系统分为七个层次，即网络层、数据库层、公共层、总线层、中间件层、表现层和应用层，则电子商务与ERP的整合不仅需要应用层各模块的重新组合与集成，而且也必须有数据库层和操作系统层来做支持。一般认为开放式数据库互连(ODBC)和不同操作系统间的互访性可以为电子商务与ERP的整合提供这种技术支撑平台。但仅仅靠目前的这些是远远不够的，留待软件厂商去解决的问题依然很多，不过电子商务和ERP的整合始终是一种趋势。

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